В «Тор-М2ДТ» интегрированы все технические достоинства базовой модификации. Боекомплект ЗРК насчитывает 16 зенитных управляемых ракет (ЗУР) 9М338, которые могут стартовать через 5—10 секунд после обнаружения цели средствами радиолокации. Интервал пуска — 2,5 секунды.
9М338 — это новая ракета, разработанная ГосМКБ «Вымпел» (входит в корпорацию «Тактическое ракетное вооружение»). Особенность снаряда заключается в меньших габаритах и отсутствии головки самонаведения (ГСН).
Чтобы ЗУР точно поражала летательный аппарат противника, российские специалисты серьёзно модернизировали систему наведения (СН), комплекс обнаружения целей, антенно-пусковую установку, увеличили производительность бортовых компьютеров и усовершенствовали алгоритмы их работы.